Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmeff2Q9QYM9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmeff2Q9QYM9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms