Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcsk1nQ9QXV0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcsk1nQ9QXV0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcsk1nQ9QXV0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcsk1nQ9QXV0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcsk1nQ9QXV0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcsk1nQ9QXV0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcsk1nQ9QXV0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcsk1nQ9QXV0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcsk1nQ9QXV0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcsk1nQ9QXV0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcsk1nQ9QXV0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcsk1nQ9QXV0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcsk1nQ9QXV0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcsk1nQ9QXV0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcsk1nQ9QXV0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms