Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Trp53inp1Q9QXE4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trp53inp1Q9QXE4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms