Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Aldh9a1Q9JLJ2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Aldh9a1Q9JLJ2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Aldh9a1Q9JLJ2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Aldh9a1Q9JLJ2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aldh9a1Q9JLJ2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aldh9a1Q9JLJ2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms