Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LitafQ9JLJ0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms