Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prg3Q9JL95 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prg3Q9JL95 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prg3Q9JL95 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms