Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scamp5Q9JKD3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms