Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Uchl3Q9JKB1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Uchl3Q9JKB1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uchl3Q9JKB1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms