Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pard6bQ9JK83 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pard6bQ9JK83 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pard6bQ9JK83 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Pard6bQ9JK83 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pard6bQ9JK83 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Pard6bQ9JK83 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pard6bQ9JK83 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pard6bQ9JK83 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pard6bQ9JK83 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pard6bQ9JK83 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pard6bQ9JK83 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pard6bQ9JK83 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pard6bQ9JK83 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pard6bQ9JK83 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms