Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR5

Akip1, A-kinase-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akip1Q9JJR5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Akip1Q9JJR5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Akip1Q9JJR5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms