Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIZ0

Cml1, Probable N-acetyltransferase CML1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml1Q9JIZ0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cml1Q9JIZ0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cml1Q9JIZ0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cml1Q9JIZ0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms