Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms