Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Eif3fQ9DCH4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eif3fQ9DCH4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eif3fQ9DCH4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms