Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med27Q9DB40 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms