Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms