Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Y7

1700025F22Rik, RIKEN cDNA 1700025F22, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700025F22RikQ9D9Y7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700025F22RikQ9D9Y7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700025F22RikQ9D9Y7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms