Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Q9D9H8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Q9D9H8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q9D9H8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q9D9H8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Q9D9H8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Q9D9H8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Q9D9H8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms