Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2af1Q9D883 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms