Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms