Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tgm5Q9D7I9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgm5Q9D7I9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms