Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9D7E4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9D7E4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9D7E4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9D7E4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9D7E4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9D7E4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9D7E4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9D7E4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9D7E4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9D7E4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9D7E4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9D7E4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D7E4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D7E4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D7E4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D7E4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms