Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MsraQ9D6Y7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MsraQ9D6Y7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MsraQ9D6Y7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MsraQ9D6Y7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MsraQ9D6Y7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MsraQ9D6Y7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MsraQ9D6Y7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MsraQ9D6Y7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MsraQ9D6Y7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MsraQ9D6Y7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MsraQ9D6Y7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MsraQ9D6Y7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MsraQ9D6Y7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MsraQ9D6Y7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MsraQ9D6Y7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MsraQ9D6Y7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MsraQ9D6Y7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms