Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ndufb8Q9D6J5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms