Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G3

2900055J20Rik, RIKEN cDNA 2900055J20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2900055J20RikQ9D6G3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
2900055J20RikQ9D6G3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms