Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Z5

Mss51, Putative protein MSS51 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mss51Q9D5Z5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mss51Q9D5Z5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mss51Q9D5Z5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms