Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms