Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syce1Q9D495 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms