Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms