Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rufy3Q9D394 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms