Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Obox1Q9D350 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Obox1Q9D350 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Obox1Q9D350 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Obox1Q9D350 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Obox1Q9D350 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Obox1Q9D350 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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