Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
1700034E13RikQ9D2T6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700034E13RikQ9D2T6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms