Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc47Q9D024 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc47Q9D024 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms