Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Acsl3Q9CZW4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Acsl3Q9CZW4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms