Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab3bQ9CZT8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms