Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RpainQ9CWY9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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