Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpusd4Q9CWX4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd4Q9CWX4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms