Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NubplQ9CWD8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms