Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Sycp2Q9CUU3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Sycp2Q9CUU3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Sycp2Q9CUU3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Sycp2Q9CUU3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms