Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Otud1Q9CUB6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms