Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CRW3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CRW3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CRW3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CRW3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CRW3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CRW3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9CRW3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CRW3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CRW3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CRW3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CRW3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CRW3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CRW3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CRW3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CRW3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CRW3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CRW3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9CRW3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CRW3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CRW3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRW3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CRW3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CRW3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CRW3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CRW3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CRW3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CRW3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CRW3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CRW3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms