Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
4931417E11RikQ9CR05 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4931417E11RikQ9CR05 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms