Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmd9Q9CR00 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmd9Q9CR00 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms