Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp5f1Q9CQQ7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms