Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DenrQ9CQJ6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DenrQ9CQJ6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms