Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQF4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQF4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQF4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQF4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQF4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQF4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms