Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sar1bQ9CQC9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sar1bQ9CQC9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms