Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bcl11bQ99PV8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bcl11bQ99PV8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Bcl11bQ99PV8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Bcl11bQ99PV8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Bcl11bQ99PV8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Bcl11bQ99PV8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Bcl11bQ99PV8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Bcl11bQ99PV8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Bcl11bQ99PV8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Bcl11bQ99PV8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms