Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vgll1Q99NC0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms