Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl3Q99N95 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms