Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
PtprtQ99M80 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PtprtQ99M80 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprtQ99M80 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
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